サービスパック3以降に導入されたSystem Key機能(SYSKEY)を利用することで、アカウントデータベースに対してほかの暗号化法を追加することができます。アカウントデータベース(SAM)には、システム上のユーザーアカウントの（ハッシュされた）ログオン・パスワードがシステムキーにより暗号化され保存されており非常に重要です。この機能を利用することにより、アカウントデータベースをより安全にすることが可能です。

System Key機能を有効にするには、Syskey.exeを実行し「暗号化を有効にする」を有効にする必要があります。暗号化を有効にした場合、アカウントのデータベースキーとして以下の3種類の方法を選択することができるようになります。

起動パスワード

システム生成パスワード:フロッピーディスクに起動キーを格納する

システム生成パスワード:このコンピュータに起動キーを格納する

起動パスワードを選択した場合、システムの起動時にパスワードの入力が必要になります。
システム生成パスワードを選択した場合、システムキーをフロッピーディスクに保存し起動時にフロッピーディスクを挿入するか、システムの一部としてシステムキーを保存するか選択できます。システムの一部として格納された場合には起動時には何も要求されません。