極めて小さなプログラムで、感染、潜伏、発病といった機能を有し、生物界のウイルスにその挙動、機能が酷似していることからコンピュータウイルスと名付けられています。
詳しくは IPA の ウェブページに掲載されている、「コンピュータウイルス対策基準」（http://www.ipa.go.jp/security/antivirus/kijun952.html）の"２．用語の定義"を参照して下さい。

トロイの木馬とは、便利なソフトウェアに見せかけて、パソコン内に侵入して利用者に被害を与える不正なプログラムの総称です。
感染機能は持っていませんので感染増殖することはありませんが、パソコン内に侵入すると、トロイの木馬の内部に隠していたウイルスをパソコンに組み込んだり、パソコン内部の秘密のファイルをインターネット上に送信してしまったり、ファイルやディスク内容を破壊するなど、さまざまな被害に遭う可能性があります。
感染増殖はしないので、トロイの木馬の種類によってはウイルス対策ソフトが検知しない場合もあります。

スパイウェアとは、利用者や管理者の意図に反してコンピュータにインストールされ、利用者の個人情報やアクセス履歴などの情報を収集する不正なプログラムの総称です。
スパイウェアも、感染機能は持っていませんので感染増殖することはありません。

セキュリティホール（OSやソフトウェアなどに潜むセキュリティ上の弱点のことで脆弱性とも言います）を有したままパソコンを使用していると、ネットワークに接続しただけで感染する場合があります。これは、ネットワーク感染型ウイルスによるものです。
例えば、W32/Sasser（http://www.ipa.go.jp/security/topics/newvirus/sasser.html） の場合は、Microsoftの MS04-011 のセキュリティホールを攻略することにより感染します。また、W32/MSBlaster（http://www.ipa.go.jp/security/topics/newvirus/msblaster.html）の場合は、Microsoftの MS03-026 のセキュリティホールを攻略することにより感染します。
この事象は、外部との通信を行う機能にセキュリティホールがあることが原因で起こります。

ウイルス対策ソフトだけ入れていても、セキュリティ対策は十分とは言えません。
ウイルス対策ソフトを導入するとともに、以下の項目を実施することで、より強固なセキュリティ対策となります。

• お使いの全てのプログラムをアップデートして最新状態に保つ（脆弱性を解消する）。
• 出所の分からないファイルをダウンロードしない、開かない。
• 身に覚えのないメールの添付ファイルは開かない、URLリンク先をクリックしない。
• 自分が管理していないパソコンに自分のUSBメモリなどの外部媒体を接続しない。
• 自分が管理していないパソコンからID／パスワードを入力しない。

また、パーソナルファイアウォールなどを導入し、自分で許可したプログラムしかインターネットに接続しないように設定しておくことで、万が一不正プログラムが仕込まれてしまったとしても、情報が外部に送信されることを予防することが出来ます。

ウイルス対策ソフトでは検知出来ないスパイウェアも多数存在します。
また、ファイアウォールもしくはスパイウェア検知ソフトであっても、侵入を検知出来ないものもあります。
こうしたプログラムを勝手に送り込まれないようにするには、ウイルス対策ソフトやスパイウェア対策ソフト/ファイアウォールをインストールするだけでなく、

• Windows Updateを実行し、OSのセキュリティホールを無くす（脆弱性を解消する）。
• ウェブブラウザのセキュリティ設定を強化する（ActiveXの無効化、JavaScriptの無効化など）。
• 出所の分からないフリーソフトは使わない。
• 怪しげなサイトには立ち寄らない。どうしても見たい場合は、事前に検索サイトのキャッシュを確認する、リンク先のソースを確認する、などしてリスクを低減する。

などの対策を施しましょう。

次のような場合が考えられます。

• ウェブサイト閲覧時、ブラウザの機能(Active X)によりウイルスが勝手にダウンロードされた。
• ウェブサイト閲覧時、ブラウザの機能(JavaScript)によりウイルスが勝手にダウンロードされた。
• ウェブサイトから自分自身でウイルスをダウンロードした。
• ウイルスが感染している添付ファイル付きメールの添付ファイルを開いてしまった。
• ウイルスが感染しているUSBメモリなどの外部記憶媒体をパソコンに接続してしまった。
• ファイル共有ソフトからダウンロードしたファイルを実行してしまった。
• 既にパソコン内に入り込んでいる他の不正プログラムによって、外部から勝手にウイルスをダウンロードされた。

UNIXやLinuxであっても、数は少なくてもウイルスが存在する限り、ウイルス対策は必要と考えます。
ただ、サーバマシンとしての用途であり、クライアントマシンのようにWebサイトを閲覧したりメールを送受信したりするのでなければ、まずはウイルス対策ソフトを最新の状態で使用する、脆弱性を出来る限り解消する、を最低限行いましょう。
Windowsと同じ様に、OSや各種サービスプログラムのアップデートを欠かさず実施する（脆弱性を解消する）ことも重要です。

現状、セキュリティ対策については残念ながら「完璧」は有り得ない、ということを申し上げておきます。技術的対策だけではなく、ユーザ自身の行動や心構え、心掛けが最も重要になりつつあります。
下記サイトを参考に、ウイルス感染の被害に遭わないための対策や心掛けを認識しておきましょう。

（参考）
「ウイルスの　ゴールをゆるすな　たよれるキーパー　セキュリティ」
（IPA 2013年1月の呼びかけ）
http://www.ipa.go.jp/security/txt/2013/01outline.html

見知らぬ差出人からのメールの本文に書かれているURLリンクや、不特定多数の人間が書き込みをするウェブサイト上の掲示板の投稿文内に書かれているURLなどのリンク先ページには、ブラウザクラッシャや、Webブラウザの脆弱性を突くための悪質なJavaScriptコードが埋め込まれていることがあります。

こうしたJavaScript自体がウイルスの場合があり、そのページを閲覧しただけでウイルスプログラムが実行されてしまいます。こうしたウイルスにより、他のウイルスを勝手にダウンロードさせられたり、ということが起きる可能性があります。

現状でも、ウイルス対策ソフトを最新の状態にしたとしても、トロイの木馬やスパイウェアなどの不正プログラムは見つからないことがあります。よって、ウイルス対策ソフトを過信せず、信頼出来ないURLリンクなどは、興味本位でクリックしたりしないことをお勧めします。

怪しいURLリンクはクリックしないに越したことはありませんが、普段からの下記に示すセキュリティ対策をしておけば、大概の場合は防げると思われます。

• Windows Updateの励行
• ウイルス対策ソフトを常に最新版に保持
• ウェブブラウザのJavaScript機能を無効にする
• ウェブブラウザのActiveX機能を無効にする

Macパソコンをお使いの利用者も、Windowsパソコンをお使いの利用者と同様にウイルス・不正アクセス対策の基本を理解し、適切な対策を施すことが重要です。

Macパソコンのウイルス対策については、以下のことが挙げられます。

• お使いのMacパソコンのセキュリティアップデートを行うこと
  （参考）
  「サポートダウンロード」（Apple Japan）
  http://support.apple.com/ja_JP/downloads/
• ウイルス対策ソフトをインストールし活用すること
• パソコン内の各種ソフトウェアのアップデートを行うこと（脆弱性の解消）

その他、ウイルス対策としてIPAのウェブサイトの情報を参考にしてください。

（参考）
「IPAセキュリティセンター（IPA/ISEC）」
http://www.ipa.go.jp/security/
「IPA対策のしおりシリーズ」
http://www.ipa.go.jp/security/antivirus/shiori.html
「パソコンユーザのためのウイルス対策 7箇条」
http://www.ipa.go.jp/security/antivirus/7kajonew.html
「メールの添付ファイルの取り扱い 5つの心得」
http://www.ipa.go.jp/security/antivirus/attach5.html

ウイルスや不正アクセスの攻撃対象となるのは、『利用者の多い環境』です。
つまり、『Windowsが悪い』のではなくて、たまたまWindowsが『広く使われている』から、攻撃の対象となるのです。

よって、Macが『広く使われる』ようになれば、当然攻撃の対象となるのです。また、『広く使われる』ようになれば、ユーザの裾野も広くなり、セキュリティ対策に関しての初心者も増加することになりますから、被害が減る理由にはなりません。
また、たとえ Mac/UNIX と言えど、脆弱性は存在します。

従いまして、Windowsを排除しMacに置き換えたとしても、ほんの一時的な対策にはなるかも知れませんが、恒久的な対策にはなり得ません。

お使いのパソコンに、ウイルス対策ソフトウェアはインストールされているでしょうか。
一度、ウイルス検索エンジンおよびウイルスパターンファイル(定義ファイル)を最新の状態にして、ウイルスチェックすることをお勧めします。

Macパソコン用のウイルス対策ソフトについては、少なくても次のものはあるようです。

（参考）
「Norton 製品とサービス」（シマンテック）
http://jp.norton.com/products/#MAC
「マカフィー インターネットセキュリティ 2013 Mac版」（マカフィー）
http://www.mcafee.com/japan/home/pd/Internet_Security_for_mac/
「Macのセキュリティ・ウイルス対策特集」（トレンドマイクロ）
http://safe.trendmicro.jp/purchase/vb/mac.aspx
「試用版ダウンロード」（カスペルスキー）
http://www.kaspersky.co.jp/trials

現在まで、BIOSを破壊するウイルスは存在していますが、BIOSに入り込んで動作するウイルスは存在しないと言えます。

マザーボードが発する「Virus Warning」は、その時点で起動しているシステムが、ハードディスク上のパーティションテーブルやブートセクタが書き換えようとしている時に、警告として出るものです。つまり、BIOSがウイルス感染している訳ではありません。
ちなみにLinuxなどのOSでは、BIOSのウイルス警告機能と互換がありませんので、警告が多発したりします。

まずはマザーボードのBIOSを工場出荷時の状態に戻すことで、問題の切り分けをするしかないと思われます。
BIOSに問題があると、ご自身で上書きすること自体が拒否されている可能性もあるため、一時、メーカに送ってROM交換などの処置をしてみるべきです。
さらに、パソコン本体は必要最小限の構成にして購入時の状態に初期化し、しばらく様子を見てください。

もし自作パソコンであれば、グラフィックカードなどのハードウェアの相性が悪い場合もありますので、それぞれハードウェアのメーカの情報を調べてみてください。他の部品に換えてみて、トラブルシューティングするのも、一つの手です。

たとえインターネットに接続していなくても、セキュリティ上、問題が生じる場合があります。

ハブやスイッチなどを介して複数台のパソコンを接続してLANを構成している場合は、ネットワーク感染型のウイルスに感染したパソコンが接続された場合に、他のパソコンにウイルスが感染する恐れがあります。