平成１４年度未踏ソフトウェア創造事業


採択テーマ概要

１．担当ＰＭ 　村岡　洋一（早稲田大学　理工学部情報学科　教授）
２．採択者氏名 　（代表）　清水　佳奈　　（共同開発者）　秋岡　明香
３．テーマ名 　遺伝子解析支援データーベースの構築
４．採択金額 　3,500,000円
５．テーマ概要

近年ゲノム研究が大きな注目を浴びており，世界中で生成される遺伝子データは日々増え続けている．遺伝子解析の研究を行なう上で，調査対象である遺伝子と類似した遺伝子や関連する遺伝子を探し出すことは必須である．しかし現状でこの検索作業を行なうには，膨大な計算時間と入力作業を強いられる．また，新たな遺伝子データが追加されるたびに，検索作業を再度やり直す必要がある．また，必要な情報を検索するためには，高度な技術が必要とされている．

そこで本プロジェクトでは，これらの遺伝子データを一定の基準の下に整理・分類し，過去にはロボット型検索エンジンがWWWの常識を覆したように，ゲノム研究における遺伝子データ検索の効率を飛躍的に向上させる．

具体的には，最新の遺伝子データセットにおいて，全ての遺伝子データ間で類似度を計算，分類したデータベースを構築し，使いやすいユーザーインターフェースと共に提供する．このようなデータベースを構築しアップデートし続けることで，利用者は常に最新のデータベースから，必要な情報のみを瞬時に取り出すことが可能となる．これにより，ゲノム研究者は本システムが提供する情報に基づき，新たな発見をすることに集中できる．

従来，全ての遺伝子データ間で類似度の計算を行なった結果を提供するシステムはなく，ゲノム研究に大きく貢献する．また，本プロジェクトでは，システムをモジュールにより構成することで，類似度計算以外の解析も容易に行なえるように配慮している．
６．採択理由

分野＝アプリケーション（バイオ）。
遺伝子解析支援という新しい分野の取り組みを評価して、採択としました。なお、申請者は当該PMの研究室所属の大学院学生ですが、申請については一切相談は受けておりません。